Atriyal septal defekli hastalar kalb içi iltihab riski olduğundan dolayı sünnet, diş çekimi gibi ufak cerrahi girişimlerden önce mukakkak kalp doktoruna danışmalı ve işlem öncesi koruyucu maksatlı antibiyotik tedavisine alınmalıdır.
Bu durum ameliyat sonrası dönem için geçerli değildir. Erken bebeklik döneminde tespit edilen şikayetleri olmayan hastalar ameliyat yaşına kadar 6 ay aralarla takip edilmelidir.. Ayrıca ağır beden işi ve yüksek efor gerektiren spor faaliyetlerinden kaçınmalıdırlar .